1867年，基督教卫理公会由九江传入江西，在九江奠定基础后，逐步向江西腹地进行传教。先后成立了南城、赣北、抚河三个教区。1894年发展到南昌市建立四个教堂（清钟堂、新民堂、志道堂、德胜堂），隶属于南赣教区领导。
其他传教团体也相继进入江西，如中华基督教圣公会、中华基督教兄弟会、中华基督江西内地会、长老会、安息日会、基督徒聚会处等一些教派组织。
19世纪末20世纪上半叶，基督教深入到江西各县甚至村镇，教会在各地都建有教堂，而且还建立起包括育婴堂，小学，中学，修道院，医院等在内的大量附属机构，并且有纺纱厂，织布厂等教会产业以及大量田产，形成了一整套教会系统，由教会机构和外国领事管辖。
新中国成立后，1958年11月，江西省正式成立了“江西省基督教三自爱国运动委员会”。各地教会先后实行联合礼拜，宗派性组织逐步消失。1963年10月和1980年12月10日，江西省基督教分别召开了第二次和第三次代表会议。1980年成立全省教务性机构——“江西省基督教协会”。此后，分别于1987年3月、1992年6月、1997年11月、2003年8月、2014年2月召开了江西省基督教第四、五、六、七、八次代表会议。
目前，江西省基督教有大专神学院校一所，即江西圣经学校。其前身为1992年9月在南昌市创办的“江西省基督教教牧人员进修班”，1993年4月更名为“江西省基督教圣经学校”，学制一年。1998年改学制两年，2011年经国家宗教局审核批准确认为中等专业宗教院校，2015年6月，国家宗教事务局批复同意江西圣经学校升格为学制3年的大专神学院校。
截止2015年底，全省基督教有教堂和聚会点数量约3000个；信徒数量约53万余人；经省民宗局认定备案的教职人员数量：2644人。基督教三自或“两会”组织66个。
